L'Archivio storico conserva sia i documenti originali prodotti durante lo svolgimento dell'attività scientifica, istituzionale e amministrativa dall'Accademia delle Scienze di Torino sia numerosi fondi personali.

Il recente progetto di riordino e inventariazione, condotto d'intesa con la Soprintendenza archivistica e bibliografica del Piemonte e della Valle d'Aosta, sostenuto da un finanziamento della Presidenza del Consiglio dei Ministri sui fondi Otto per mille a diretta gestione statale, ha mantenuto l'articolata struttura che è il risultato di più interventi occorsi in oltre due secoli che, per ragioni soprattutto di storicità, non si è considerato opportuno stravolgere.

L'inventario a stampa dell'archivio è disponibile nel volume Tra le carte della scienza. L'archivio storico dell'Accademia delle Scienze di Torino dal passato alla modernità, Torino, Hapax, 2017